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Gene interferenceは目的遺伝子の不活性化に用いられます。センス及びアンチセンスRNAは、どちらも蛋白質の合成を妨げることにより対応する遺伝子の発現を阻害することが既に知られていますが、それとは別にここ数年RNAを用いたGene interferenceの系が開発されてきています。RNA interference (RNAi, RNA干渉)と呼ばれるこのプロセスには、2重鎖RNA(dsRNA)が使用されています。当初、無脊椎動物に使用するために開発されましたが、その後は脊椎動物にも使われるようになりました。不明瞭だった問題点を乗り越え、現在では哺乳動物、特にマウスに使えることが分かってきています。RNA interference法は、1998年に線虫Caenorhabditis elegansを用いて開発されました(Fire, et.al.,1998)。遺伝子"ノックアウト"法として、相同的組換えによる遺伝子の不活化された個体作製が可能です。

 
2-nt(ヌクレオチド)の3'オーバーハングを対称的に持つ2本鎖21-nt RNAが、ターゲットRNAに対して細胞内におけるRNA分解機構のガイド役をしていることが示されました。Tuschlらのグループは、2本鎖siRNA(short interfering RNA)の抑制効率を、siRNAの長さ、3'オーバーハングの長さ、及びオーバーハング配列を体系的に調べています。Elbashirらのグループは、この技術を利用していろいろな哺乳動物の細胞株について調べました。Hela細胞における蛋白質生合成を特異的に抑制したことを最近発表しています。
Xiaomei Baiらのグループは、Genset Oligos(R)で合成されたRNA interferenceフラグメント(siRNA GalTII-Aと-B)を用いてGAG GalTIIのcDNAを同定し、1,3-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼと記述されていたものであることを報告しています。
 
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